Законодательство РФ не содержит императивного требования об обязательной сертификации по ISO 14001 для всех хозяйствующих субъектов, поэтому формально процедура остаётся добровольной. Однако для предприятий I и II категорий по степени негативного воздействия на окружающую среду, а также для компаний, работающих на шельфе, в Арктической зоне или на особо охраняемых природных территориях, наличие СЭМ становится де-факто обязательным, поскольку без неё практически невозможно получить комплексное экологическое разрешение и соответствовать ужесточённым требованиям природоохранных ведомств.